从头设计阻断抗体服务

1 产品概述

本产品以人工智能与蛋白质工程技术为核心，整合先进的分子设计工具，构建了从抗原功能区域分析到纳米抗体筛选与优化的全流程解决方案。通过精准的阻断区域预测、智能化的短肽和纳米抗体设计、以及高通量计算筛选，该服务可以快速生成针对目标蛋白的高亲和、高特异性纳米抗体。这种新颖、高效、系统化的解决方案，将显著推动基础科研与生物医药领域的技术进步，为客户提供全方位支持。

2 产品筛选流程

2.1 确定抗原蛋白的阻断区域

在抗原蛋白与其他分子作用的机制中，关键阻断区域通常决定了分子间的功能性结合。通过对抗原蛋白功能区域或与感染受体蛋白结合区域的深入分析，利用生物信息学工具明确阻断区域。此过程为设计高效阻断抗体提供了精准的科学依据。

2.2 从头设计结合短肽

结合短肽是设计阻断抗体的关键种子分子。我们采用最先进的蛋白质设计工具RFdiffusion，从头生成100条不同长度（7、11、15个氨基酸）的短肽分子，这些短肽全面覆盖潜在的结合位点，确保候选分子多样性和适用性。

2.3 选择高亲和短肽

通过分子对接，评估所有候选短肽与抗原蛋白的结合模式，筛选出与阻断区域具有高亲和性和高选择性的TOP 10短肽。这些短肽将为后续的纳米抗体设计提供可靠模板。

2.4 构建纳米抗体文库

将筛选出的TOP 10短肽分别插入到纳米抗体骨架的CDR3区域，选择性突变优化CDR1和CDR2区域，通过突变和组合策略构建容量达1000条的合成纳米抗体文库。这一步大大扩展了候选分子的潜在功能，同时提升了抗体文库的多样性和适用性。

2.5 HDock对接评估

利用HDock分子对接工具，进一步筛选纳米抗体文库中与抗原蛋白有较强亲和力的候选分子，按结合亲和力高低排列，筛选TOP 10纳米抗体进入下一步评估。这一过程确保了候选抗体的高亲和力和稳定性。

2.6 AlphaFold整体评估

采用AlphaFold技术对筛选出的纳米抗体与抗原蛋白复合物的结构进行预测和评估，分析抗体与阻断区域的结合稳定性与特异性，最终选出具备强竞争抑制作用的高亲和纳米抗体，确保其具备预期功能。

3 拟交付结果