多模态互作蛋白筛选
发布日期:2024-12-10
发布者: 合肥科晶生物
1 产品概述
多模态蛋白互作筛选是一种集成了多种先进工具和多层次筛选方法的创新型研究平台,旨在实现对蛋白质互作的高效预测和精确筛选。本产品采用了MegaDock、HDock和AlphaFold等当前领先的技术工具,通过多层次的筛选策略,从全蛋白数字文库逐步排除不符合条件的蛋白互作候选。此外,平台综合考虑结合能与结构预测两大核心要素,将筛选结果的科学性与全面性提升至更高水平。通过这种系统性的筛选流程,为探索蛋白质相互作用的机制、揭示疾病的生物学基础以及基础科学的发展提供了新思路和新方法。
2 产品筛选流程
2.1 MegaDock初步对接筛选
Megadock作为初筛工具,能够快速分析大规模蛋白互作数据,通过高效对接模拟筛选出潜在意义较大的蛋白互作数据。选择Top 200候选蛋白进入下一轮筛选。
2.2 HDock精细化对接筛选
HDock对初筛结果进行更为精细的筛选,依据结合能的绝对分值,评估蛋白互作的稳定性和亲和力,进一步缩小筛选范围,锁定表现优异的候选数据。选择Top 10候选蛋白进入下一轮筛选。
2.3 AlphaFold一对一精准分析
AlphaFold在最终的精细分析中发挥关键作用,通过计算pTM和ipTM值,从蛋白质复合物结构预测和结合界面建模方面验证筛选结果的可靠性和生物学意义。
3 拟交付结果
1 | 诱饵蛋白的三维结构模型,并提供建模评分 |
2 | 诱饵蛋白与目标物种全蛋白的MegaDock对接原始数据 |
3 | 诱饵蛋白与Top 200 候选蛋白的HDock对接原始数据 |
4 | 诱饵蛋白与Top 10 候选蛋白的AlphaFold 3评估原始数据 |
5 | 全数据Excel表格及项目服务报告 |