ESM Fold

ESM Fold 是一种基于超大型语言模型的革命性蛋白质结构预测工具，能够从蛋白质一级序列直接推断出完整的三维结构，并达到原子级精度。该模型采用了150亿参数，通过学习蛋白质结构的原子分辨率图像，不仅显著提高了预测的分辨率，还实现了对蛋白质结构预测的数量级加速，开创了蛋白质结构预测的新篇章。ESM Fold 的最大亮点在于其高效性和高精度的结合。它能够以超快速的方式完成大规模预测，对超过2.25亿个蛋白质序列实现了精准建模，同时对超过6.17亿个元基因组蛋白质序列进行结构推断，进而构建了ESM元基因组图谱。与传统依赖物理建模或神经网络的结构预测方法相比，ESM Fold 在计算效率和预测能力上实现了显著突破，大幅减少了计算资源的需求。

此外，ESM Fold 在应用场景中展现出强大的潜力。其高效预测能力使得大规模的蛋白质结构研究成为可能，为基础生物学研究、疾病相关蛋白的靶标发现、药物设计以及蛋白质工程提供了强有力的支持。通过精准预测蛋白质序列与三维结构的关系，ESM Fold 推动了科学家对生命分子机制的深入理解，并为探索未知元基因组中的蛋白质序列提供了全新的解决方案。

图1：ESM Fold预测蛋白质模型，与AlphaFold预测模型无较大差异（RMSD=0.554）